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Development and evaluation of a method for the quantification of airborne Thermoactinomyces vulgaris by real-time PCR.
(Développement et évaluation d’une méthode destinée à la quantification de Thermoactinomyces vulgaris dans l’air par PCR en temps réel).
Article
Publié dans : Journal of Microbiological Methods, Pays-Bas, vol. 92, n° 1, janvier 2013, pp. 25-32, ill., bibliogr. (En anglais)
Les actinomycètes sont omniprésents dans l’environnement et peuvent présenter un risque pour les travailleurs exposés. Ceci est notamment le cas pour Thermoactinomyces vulgaris pour lequel les concentrations peuvent dépasser 107 UFC/m3 dans l’air des plates-formes de compostage. L’exposition des travailleurs à ces bioaérosols peut générer diverses pathologies. A l’heure actuelle, il n’existe pas de valeur limite d’exposition professionnelle pour ces agents microbiens. L’objectif de cette étude était de développer et d’évaluer une méthode permettant de quantifier T. vulgaris dans l’air. Cette méthode est fondée sur l’extraction d’ADN à partir d’échantillons d’air susceptibles de contenir la bactérie modèle suivie d’une analyse par qPCR. La méthode développée a été comparée aux méthodes de comptage par microscopie à épifluorescence et au dénombrement par culture sur milieu gélosé en conditions de laboratoire. Elle a ensuite été évaluée en conditions réelles d’exposition pour la mesure de T. vulgaris dans l’air de plates-formes de compostage. Les résultats montrent que la méthode est spécifique, sensible est répétable. Elle a permis de mettre en évidence la présente de T. vulgaris sur les plates-formes investiguées à des concentrations comprise entre 100 et 100 000 copies de gènes/m3.
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