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Microdissection, mRNA amplification and microarray : a study of pleural mesothelial and malignant mesothelioma cells.
(Microdissection, amplification d'ARNm et microréseaux de gènes : une étude des cellules pleurales et mésothéliales et mésothéliomales malignes).
Article
Publié dans : Biochimie, vol. 86, n° 1, janvier 2004, pp. 13-19, ill, bibliogr. (En anglais)
Les études des altérations moléculaires dans les cellules tumorales par les microréseaux de gènes sont souvent gênées par l'hétérogénéité inhérente aux tissus. L'émergence de la microdissection par capture laser (MCL) a permis de relever ce défi car elle donne accès aux cellules cancéreuses isolées de leur environnement tissulaire originel. Dans cette étude, des cellules mésothéliales et des cellules mésothéliomales malignes ont été disséquées à partir de prélèvements chirurgicaux. Les ARN amplifiés des cellules mésothéliales et mésothéliomales microdisséquées ont permis de mesurer l'expression globale des gènes par des microréseaux de gènes 10K dans quatre expériences indépendantes. 9850 gènes humains annotés ont été criblés dont 1275 satisfaisaient aux critères de validation des résultats d'analyse. Parmi ces gènes, 302 étaient sur-exprimés et 160 sous-exprimés dans les cellules mésothéliomales microdisséquées comparées aux cellules mésothéliales microdisséquées. Les expressions différentielles de 8 gènes, nommés selon la nomenclature HUGO, BF, FTL, IGFBP7, RARRES1, RARRES2, RBP1, SAT et TXN étaient augmentées alors que six gènes ALOX5AP, CLNS1A, EIF4A2, ELK3, REQ et SYPL étaient sous-exprimés dans les cellules de mésothéliomes microdisséquées. La sur-expression de la chaîne légère de la ferritine (FTL) était confirmée par PCR quantitative en temps réel. L'approche a permis un examen étendu du mésothéliome in situ et a validé une méthode fiable pour la découverte de nouveaux marqueurs utiles au diagnostic et au traitement du mésothéliome pleural malin.
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